BRIN tidak hanya berkonsentrasi pada konservasi dan pencatatan secara rinci, namun juga mempersiapkan pemanfaatan biodiversitas sebagai sumber tanaman obat dan produk pangan berbasis teknologi canggih, meski saat ini baru 17 dari 57 jenis mangrove yang terdaftar di Kebun Raya Mangrove Surabaya.

Sebagai objek wisata, Kebun Raya Mangrove Surabaya menawarkan wisata edukasi mangrove. Pengunjung dapat menikmati kanopi selebar 1 meter dari susunan bilah papan dan bambu sepanjang 630 meter yang membelah hutan mangrove. Juga terdapat menara pandang setinggi 12 meter, dermaga perahu, dan area piknik (picnic ground).

Wisata perahu menyusuri sungai selama 5,4 kilometer merupakan pilihan menarik untuk menyaksikan pesona hutan mangrove dan melihat 28 jenis burung penghuninya. Jembatan gantung kokoh dari kayu dan bambu sepanjang 30 meter telah dibangun untuk menyambungkan kawasan Mangrove Gunung Anyar dan Mangrove Medokan Sawah.