Adapun Tol Jogja Solo Seksi II dibangun dari Purwomartani sampai Gamping sepanjang 23,43. Tol ini akan dibangun melayang di atas Ring Road Utara Sleman.

Seksi II juga terbagi dalam dua paket, yakni Paket 1 dari Purwomartani sampai Monjali sejauh 9,43 kilometer dan Paket 2 dari Monjali sampai Gamping sejauh 14 kilometer. Seksi ini akan dibangun terakhir dan ditargetkan selesai pada 2025. Dalam pembangunan Seksi II, ada dua proyek lain yang ditargetkan selesai pada 2024, yakni dari Purwomartani sampai Maguwoharjo sepanjang 3,63 kilometer dan dari Trihanggo hingga Junction Sleman sejauh 3,25 kilometer.

Seksi III Tol Jogja Solo dibangun dari Gamping sampai Bandara Internasional Yogyakarta atau Yogyakarta International Airport (YIA) sepanjang 30,77 kilometer. Seksi III atau dikenal dengan Tol Jogja YIA ditargetkan selesai pada 2024 dan dibangun dalam dua paket, yakni paket pertama dari Gamping sampai Wates sejauh 17,45 kilometer dan paket kedua dari Wates sampai Bandara YIA sejauh 12,32 kilometer.