DAOP V
Wilayah Jawa Tengah bagian selatan tergabung dalam Daop V berpusat di Purwokerto. Beberapa kabupaten yang tergabung di dalamnya adalah Banyumas, Brebes bagian selatan, Cilacap, Kebumen, Purworejo, Tegal, dan sebagian kecil Jawa Barat yakni Banjar.
Beberapa stasiun besar yang ada di bawah Daop V Purwokerto di antaranya Stasiun Purwokerto, Stasiun Kutoarjo, Stasiun Kroya, Stasiun Cilacap, dan Stasiun Karanganyar.
DAOP VI
Kemudian, wilayah Yogyakarta dan Soloraya termasuk ke dalam Daerah Operasi VI. Beberapa wilayah yang mengikuti Daop VI adalah Daerah Istimewa Yogyakarta meliputi Kulon Progo, Bantul, dan Sleman.
Untuk bagian Jawa Tengah meliputi Purworejo, Klaten, Surakarta, Boyolali, Sukoharjo, Wonogiri, Karanganyar, dan Sragen.
Daop VI Yogyakarta mempunya beberapa stasiun besar yakni Stasiun Tugu, Stasiun Lempuyangan, Stasiun Klaten, Stasiun Solo Balapan, Stasiun Purwosari, dan Stasiun Solo Jebres.