Juga koleksi etnografi yang menggambarkan identitas suatu etnis seperti kacip dan koleksi historika yang bernilai sejarah, misalnya meriam dan senapan laras panjang.
Koleksi tersebut dipamerkan di ruang berbeda sesuai kategori. Misalnya di Ruang Pengenalan ada koleksi pasren atau krobongan, tempat menyepi dan berdoa dalam adat tradisional Jawa. Pasren ini terdiri dari tempat tidur, bantal-guling, kelambu, lampu robyong dan jlupak, dan sepasang patung Loro Blonyo.
Kemudian di Ruang Pra Sejarah ada koleksi yang menggambarkan bagaimana kehidupan manusia pada saat belum mengenal tulisan, berburu, dan bercocok tanam dengan cara sederhana. Pada masa itu, manusia juga melakukan upacara-upacara yang berhubungan dengan roh, nenek moyang, dan penguburan. Di ruangan ini, pengunjung bahkan bisa melihat kerangka tulang manusia yang dikubur di peti kaca.
Selanjutnya di Ruang Klasik dan Islam terdapat berbagai koleksi bernuansa religi, seperti Al-Qur’an tertua, naskah lama, dan koleksi yang berhubungan dengan penyebaran agama Islam.
Memasuki Ruang Batik, Anda bisa melihat koleksi batik, proses membatik, hingga pakaian adat Jawa untuk pernikahan. Sementara itu di Ruang Wayang dan Topeng ada banyak jenis wayang dari berbagai daerah, dari yang berbahan kulit sapi hingga replika wayang orang. Kemudian ada koleksi topeng-topeng kayu yang ditata apik.
