Kariernya di dunia pendidikan telah dimulai sejak bertugas di ITB pada tahun 1962 dan resmi purnabakti sejak bulan Agustus 2005.

Sejak tahun 1973, beliau merupakan Ketua Program Tahun Pertama Bersama (TPB) ITB yang pertama, beberapa kali menjadi Ketua Jurusan Kimia, dan PD I Kimia Biologi.

Beliau juga pernah mengepalai LP3 (Lembaga Pengkajian dan Pengembangan Pendidikan) di ITB, yang salah satu kegiatannya adalah memberikan pelatihan dasar-dasar pedagogi bagi dosen ITB yang baru bertugas, yang hampir semuanya tidak memiliki dasar keguruan.

Selama mengabdi, Prof Susanto memiliki banyak peran pada pengembangan institusi Kimia, FMIPA, ITB, dan AIPI. Beliau banyak berkontribusi pula pada pendidikan, khususnya pendidikan kimia.