Kurun beberapa waktu, Habibie ditunjuk menjadi orang nomor satu di Indonesia tahun 1998-1999. Ainun tentu saja menjadi ibu negara yang harus mendampingi suaminya bekerja untuk negara. Sosok mereka pun menjadi sorotan masyarakat.
Selain berperan sebagai Ibu Negara Republik Indonesia ketiga, Ainum juga berkiprah dalam membantu memperjuangkan para tunanetra agar bisa melihat kembali dengan normal. Dia mendirikan bank mata yang masih menjadi pro kontra pemerintah. Donor mata diharamkan sehingga menjadi masalah tersendiri.
Eksistensi bank mata sudah ada sejak tahun 1968. Bank mata ada untuk membantu para tunanetra di negara kita. Kala itu, peran Ainun bisa memperjuangkan peraturan tepat untuk donor mata. Fatwa halalnya donor mata berhasil karena Ainun.
Kebaikannya itu tidak dapat dinilai dengan uang. Orang dengan cacat mata sangat bangga dengan sosok Ainun karena membantu mengembalikan penglihatannya.
