Akibatnya, Sunan Bonang menghadapi resistensi dari penduduk Kediri berupa perdebatan maupun pertarungan fisik dengan Ki Buto Locaya dan Nyai Plencing. Mereka merupakan tokoh penganut ajaran Bhairawa-bhairawi di Kediri.
Atas perintah Raden Patah, Sunan Bonang pergi ke Demak untuk menjadi imam Masjid Demak. Di sinilah ia diberi gelar Sunan Bonang yang bermakna guru suci yang berkediaman di Desa Bonang, Demak. Selang beberapa saat, ia pun meninggalkan kedudukannya sebagai imam Masjid Demak.
Tahun 1480 M, Sunan Bonang berpindah ke bagian belakang dalem Kadipaten Lasem, kediaman kakak kandungnya yang bernama Nyai Gede Maloka. Sepeninggalan suaminya bernama Pangeran Wirabjra, Nyai Gede Maloka mengambil alih bagian dari pemerintahan di dalem Kadipaten.
Ia memerintahkan Sunan Bonang untuk merawat makam nenek mereka yang berasal dari Champa. Sunan Bonang juga diperintah untuk merawat makam Pangeran Wirabjra dan putranya.
