5. Pondok Pesantren Al Amien Prenduan Sumenep
Pondok pesantren Al Amien Prenduan Sumenep telah berdiri sejak 1952. Lembaga ini menawarkan program pendidikan formal mulai dari pendidikan anak usia dini, taman kanak-kanak, madrasah ibtidaiyah, hingga madrasah aliyah.
Penerapan kurikulum seperti sekolah-sekolah negeri sebagaimana ditetapkan Departemen Agama dan Departemen Pendidikan Nasional. Ponpes di Dunglaok, Pragaan Laok, Pragaan, Kabupaten Sumenep ini kurikulumnya fokus studi agama dan ilmu pengetahuan bahasa Arab serta Inggris.
6. Pondok Pesantren Modern Muhammadiyah Lamongan
Lembaga modern ini didirikan K.H.M Ridiwan Syarqowi pada 1983 yang menganut sistem klasikal. Lembaga ini ditetapkan sebagai pesantren kader persyarikatan oleh tokoh-tokoh pergerakan, dakwah, dan pembaharuan pendidikan di wilayah Pantura Lamongan.
Tersedia lembaga pendidikan formal mulai dari prasekolah hingga perguruan tinggi. Ponpes di Jalan Pondok, Desa Paciran, Kecamatan Paciran, Kabupaten Lamongan ini memiliki pendidikan non formal, meliputi Taman Pendidikan Al-Qur'an, Darul Aitam, Madrasah Diniyah, dan Ma'had Ali.
7. Pondok Pesantren Mambaul Ulum Bata-Bata Pamekasan
Pondok Pesantren Mambaul Ulum Bata-Bata terletak di Morsongai, Panaan, Kecamatan Palengaan, Kabupaten Pamekasan. Ponpes ini merupakan lembaga pendidikan agama Islam dari jenjang pendidikan anak usia dini hingga madrasah aliyah.
Ponpes ini juga memiliki jenjang pendidikan Sekolah Menengah Kejuruan (SMK) dengan semua pendidikannya menerapkan kurikulum madrasah. Lembaga pendidikan ini telah berdiri sejak 1943.
